Araştırmacılar COVID-19'un "Aşil Topuğu"nu Keşfetti

Bu çalışma bakteriler üzerinde yapılmıştı, ancak aynı prensip,24 Haziran'da Nucleic Acids Research dergisinde yayınlanan çalışmayı destekleyen moleküle de uygulandı. Tiago Cordeiro, bilimsel bir tanıtım konferansı için hazırladığı sunumu Observador'a gösterirken, "Daha önce hiç kimse N proteinini derinlemesine incelememişti," diye itiraf ediyor.

Daha pratik bir ifadeyle, bu koronavirüslerin bulaşma ve enfeksiyon sürecinde gerçekleşenler şöyledir: Virüs, konakçının ağzından veya burnundan girer ve Spike proteini sayesinde solunum yolundaki belirli hücrelere yerleşip girme yeteneğine sahiptir. Virüs, viral yükünü (RNA'sını) bu hücrelerde serbest bırakarak diğer virüsleri üretir ve bu virüsler daha sonra vücut hücrelerine yayılarak sonunda diğer insanlara bulaşır. Bu RNA, yalnızca N proteininin aktivitesi nedeniyle virüs içinde organize olur.

Spike (S) ve bu virüs ailesinin diğer iki yapısal proteini olan Zar (M) ve Zarf (E) kapsülün dış kısmında bulunurken, Nükleokapsid (N) kapsülün içinde bulunur ve bu virüslerin her birinin genetik bilgisini barındırır. Dolayısıyla, N proteini, RNA'yı korumaktan sorumlu olmasının yanı sıra, replikasyonunu sağlayan en önemli protein haline gelir - " N proteini olmadan virüs replikasyonu olmaz " - ve dolayısıyla enfekte organizmanın hücreleri tarafından viral materyalin çoğalmasını sağlar.

Tiago Cordeiro, ofisinin duvarına astığı posterde sırasıyla turuncu ve mor renkte olan iki "alan"ı işaret ederek, "[Portekiz soruşturmasından önce] iyi bilinen şeyler bu iki yapıydı" diye devam ediyor.

Turuncu renk, molekülü RNA'ya bağlamaktan sorumlu bileşen olan NTD'yi (N-terminal alanı) temsil eder. Proteinin diğer ucunda, bu bağlanmaya katkıda bulunmanın yanı sıra proteinin yapısına ve aktivitesine katkıda bulunan diğer özellikleri de sağlayan CTD (C-terminal alanı) bulunur. Ancak bu iki alan arasında, o zamana kadar yalnızca NTD ve CTD arasında bir bağlayıcı olarak görülen başka bir molekül yer alır. Portekizli araştırma ekibi, bu küçük yapının araştırmalarında çığır açabileceğini fark etti.

Resmi adı, özünde düzensiz bağlayıcı (IDL) olan , yani diğer proteinlerin etkileşime girmesine, özellikle birden fazla N proteininin birbirine bağlanarak kompleksler oluşturmasına olanak tanıyan, özünde düzensiz bir bağlayıcıdır. Daha sonra, proteinin yapısındaki bu "küçük Velcro" nun, birkaç özdeş molekülü birbirine bağlayarak, sıvı ile jel arasında daha büyük kümeler ve "damlacıklar" oluşturduğunu keşfettiler. Virüs, kapsül içindeki RNA'sını düzenlemek için bunlara güveniyor.

Bu proteinin yapısını derinlemesine inceledikten sonra deneysel bir soru ortaya çıktı: "Bu bağlayıcıyı bozarsak ne olur?" Bileşiminden üç spesifik amino asidi (lösin) çıkararak keşfettikleri şey , IDL'nin sarmal yapısının artık bu kompleksleri oluşturamayacağı, bunların boyutunu ve stabilitesini etkileyeceği ve virüsün temel aktivitesinin, yani N proteininin sorumluluğunda olan viral genetik materyalin paketlenmesi ve çoğaltılmasının etkileneceğiydi.